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注:这是从 2022.12.29 开始记录的,在此之前的更新并未被记录其中

2024

6-12

  • 更新了文章(fasterq-dump 下载 SRA 文件时报错的解决方法(err: cmn_iter))。
    • 添加了 ascp 的替代方案。

6-09

  • 发布了新文章(获取基因组上 intron 区域及对应链信息的方法)。
  • 发布了新文章(Ensembl VEP plugins 的使用方法(Alphamissense、dbNSFP 等))。

5-10

  • 发布了新文章(fasterq-dump 下载 SRA 文件时报错的解决方法(err: cmn_iter))。

5-03

  • 发布了新文章(提取 bwa 比对中唯一比对 reads(uniquely mapped reads)的方法)。

4-24

  • 更新了文章(通过 bowtie2 + macs3 分析 ChIP-Seq 数据)。

4-20

  • 发布了新文章(bismark 分析 Bisulfite-Seq 数据的流程示例)。

4-16

  • 发布了新文章(通过 bowtie2 + macs3 分析 ChIP-Seq 数据)。

4-2

  • 发布了新文章(远程服务器无 root 权限时 LightGBM GPU 版的安装方法)。

3-18

  • 发布了新文章(全基因组 CpG (or nonCpG) 位点 bed 文件的获取方式)。

3-04

  • 更新了文章(比较转录组分析(一)—— 前提及概要)。

2-20

  • 发布了新文章(Clash for windows 中让某些域名绕过代理)。

1-20

  • 发布了新文章(通俗易懂的贝叶斯深度神经网络介绍及代码实现)。

1-03

  • 更新了文章(当 cmake 遇上 permission denied)。

2023

12-30

  • 发布了新文章(dN/dS 的计算及其核心理念)。

12-13

  • 发布了新文章(slurm 作业数组的正确使用姿势)。

11-28

  • 更新了文章(常见的一些 linux 实用命令)。

11-27

  • 更正网站规范标签。

11-24

  • 发布了新文章(DNA 语言模型 GPN 在突变效应预测中的应用及表现)。

11-22

  • 发布了新文章(深度学习 loss 追踪器(用于追踪 loss 变化))。

11-08

  • 更新了文章(贝叶斯建树之 Mrbayes 篇)。

10-30

  • 因为没梯子访问 Cloudflare 加速的页面(指博客)实在太慢了,所以在有的没的及个人介绍页面添加了梯子链接。

10-29

  • 发布了新文章(Python 循环太费时?让多进程解决这个问题(concurrent))。

10-12

  • 发布了新文章(Python seaborn 绘制复杂多变量图(hexbin + 拟合直线))。

10-09 重大更新

  • 针对 Bing 的 SEO 报告对所有文章进行了修改以优化搜索引擎扫描。

10-08 重大更新

  • 更新域名,通过脚本继承旧域名主要页面阅读量。

10-07

  • 更新了文章(贝叶斯建树之 Mrbayes 篇)。

10-05

  • 发布了新文章(关于人类基因组注释中起始和终止位点相同的现象)。

9-09

  • 为 Jusekit 系列文章新增了界面演示超链接。

9-05

  • 更新了文章(DiscoVista 可视化系统发育不一致)。

9-02

  • 更新了文章(比较转录组分析(七)—— 系统发育分析)。
  • 更新了 JuseKit,现在可以通过菜单项快速找到相应教程。

9-01

  • 发布了新文章(JuseKit(八) —— 计算转录组组装指标)。

8-27

  • 更新了文章(JuseKit(七) —— 绘制 GO 富集分析气泡图)。

8-26

  • 更新了琐碎的日常。

8-19

  • 更新了文章(关于 PAML 的一二三事)。

8-11

  • 发布了新文章(基于 js 在系列文章开头设置文章传送门(hexo + butterfly))。

8-09

  • 在系列文章(比较转录组分析 & JuseKit)的开头通过 js 引入了传送门,以实现文章之间的引流。

8-04

  • 发布了新文章(JuseKit(七) —— 绘制 GO 富集分析气泡图)。

8-02

  • 更新了文章(比较转录组分析(七)—— 系统发育分析)。

7-24

  • 简化了不必要的 web 元素。

7-19

  • 更新了文章(关于 PAML 的一二三事)。

7-16

  • 更新了文章(比较转录组分析(七)—— 系统发育分析)。

7-13

  • 更新了文章(常见的一些 linux 实用命令)。
  • 修改了部分页面布局。

7-12

  • 发布了新文章(DiscoVista 可视化系统发育不一致)。

7-08

  • 精简了部分文章内容。
  • 修改了部分文章图片大小。

7-07

  • 更新了文章(常见的一些 linux 实用命令)。
  • 发布了新文章(使用 IQTREE 计算一致性因子)。
  • 精简了部分文章内容。

7-06

  • 发布了新文章(贝叶斯建树之 Mrbayes 篇)。

7-04

  • 更新了文章(用于 IQtree 的序列串联方法)。
  • 发布了新文章(JuseKit(六) —— 绘制火山图)。

7-03

  • 解封并更新了文章(单基因 dN、dS 和 ω 的滑动窗口绘制方法)。
  • 更新了文章(关于 PAML 的一二三事)。
  • 更新了文章(生信导论)。
  • 更新了文章(比较转录组分析(一)—— 前提及概要)。
  • 更新了文章(比较转录组分析(二)—— 原始数据的质控与转录组组装)。
  • 更新了文章(比较转录组分析(三)—— 组装的质量检测与去冗余)。
  • 更新了文章(比较转录组分析(四)—— 组装的注释)。
  • 更新了文章(比较转录组分析(五)—— 转录本定量与差异表达分析)。

6-26

  • 解封并更新了文章(比较转录组分析(六)—— GO 富集分析与可视化)。

6-24

  • 更新了文章(关于 PAML 的一二三事)。
  • 解封并更新了文章(比较转录组分析(七)—— 系统发育分析)。

6-23

  • 发布了新文章(Astral 建树指南)。

6-21

  • 更新了文章(关于 PAML 的一二三事)。
  • 更新了文章 常见的一些 linux 实用命令 。
  • 更新了文章(JuseKit(三) —— 串联序列、根据id提取序列、批量修改文件尾缀)。

5-20

  • 更新了文章(关于 PAML 的一二三事)。

5-14

  • 发布了新文章(JuseKit(五) —— 用于系统发育分析的序列过滤)。
  • 修正了所有 Jusekit 文章中的下载地址。

5-6

  • 发布了新文章(关于 PAML 的一二三事)。

4-26

  • 发布了新文章(JuseKit(四) —— 序列格式转换以及 Orthogroup 的 cds 提取)。
  • 更新了文章(比较转录组分析(七)—— 系统发育分析)。

4-24

  • JuseKit 更新,先行版本已在 github 上发布。
  • 更新了文章(JuseKit(二) —— 序列id简化、加前缀尾缀或转变为物种名)。

4-20

  • JuseKit 更新,先行版本已在 github 上发布。
  • 更新了文章(比较转录组分析(五)—— 转录本定量与差异表达分析)。

4-13

  • 发布了新文章(JuseKit(三) —— 串联序列、根据id提取序列、批量修改文件尾缀)。
  • 更新了文章(JuseKit(二) —— 序列id简化、加前缀尾缀或转变为物种名)。
  • 对博客的夜间模式页面进行了完善,现在的夜间模式也能正常使用了!

4-9

  • 发布了新文章(JuseKit(二) —— 序列id简化、加前缀尾缀或转变为物种名)。

4-8

  • 发布了新文章(JuseKit(一) —— 提取最长转录本)。

4-7

  • 更新了文章 用于 IQtree 的序列串联方法。
  • 更新了杂谈,可以在琐碎的日常里偷窥 Juse 和他伙伴们的抽象大作了。

4-6

  • 发布了新文章(文献分享篇(一)—— 系统发育转录组学是否靠谱?)。

3-27

  • 发布了新文章(关于 mamba install 时会出现的两个错误解决方案)。

3-13

  • 发布了新文章(单基因 dN、dS 和 ω 的滑动窗口绘制方法)。

3-9

  • 更新了文章 常见的一些 linux 实用命令 。
  • 发布了新文章(当 cmake 遇上 permission denied)。

3-2

  • 发布了新文章(基于 Cytoscape 的富集网络图绘制)。

2-23

  • 更新了文章 常见的一些 linux 实用命令 。

2-17

  • 发布了新文章(比较转录组分析(七)—— 系统发育分析)。
  • 更新了文章 常见的一些 linux 实用命令 ,更改了其中的部分内容。
  • 更新了琐碎的日常。

2-6

  • 更新了比较转录组分析(三)文章,修改了更新日志中的 tip。

1-31

  • 修改了部分页面的布局,简化掉了一些花里胡哨的东西(虽然还存在一部分)。

1-29

  • 发布了新文章(用于 IQtree 的序列串联方法)。
  • 更新了琐碎的日常。

1-11

  • 更新了比较转录组分析(四)文章,删除了后记的题外话部分,新添了 KEGG 注释的方法。

2022

12-29

  • 开设了更新日志栏目。
  • 更新了比较转录组分析(四)文章,新添了 GO 分类柱状图的绘制方法。

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