vscode 在远程服务器上通过 jupyter notebook 使用 R

最近一段时间的关键分析要用到 R，但是办公电脑的机械硬盘前段时间出了问题，现在用 Rstudio 会非常卡顿，加上相关分析对计算资源的要求也比较高，就想着是否有什么办法能在服务器上也弄一个类似于 Rstudio 的可视化界面出来作为辅助。

不过看了一圈发现 Rstudio 的 server 版本似乎局限性不少，而且还要用到 root 权限。考虑到平时运行 Python 进行分析时大多数时候都在 jupyter notebook 上进行，就想着是否能套用过来，于是就有了这篇文章。

安装

该文章的具体实现在 Linux + mamba 环境下完成，如果你没有 conda/mamba 环境，可以参考网上资料进行安装。

首先确认你的环境中有 R，如果没有可以通过以下命令安装：

1 2	mamba install conda-forge::r-base R # 确认可以进入 R 终端，使用 q() 退出

通过 mamba 安装 IRkernel 和 jupyter（使用 conda 也行，本文章以 mamba 为准）：

1 2	mamba install r::r-irkernel mamba install anaconda::jupyter

完成上述步骤后，进入 R 终端，输入 IRkernel::installspec()：

1 2	$ R > IRkernel::installspec()

如果在 VScode 中尚未安装 jupyter 扩展，则点开侧栏的拓展页面并搜索 jupyter 安装：

新建一个 jupyter notebook 文件，使用 vscode 打开它：

点击右上角的 select kernel，此时如果仅存在 Python 相关的 kernel，则先在服务器上运行 jupyter notebook：

1	jupyter notebook

此时屏幕输出里会返回 server 的链接，例如：

1	http://localhost:8888/tree?token=11d321403f5a4d62d94d07ddae56e48017cf641c059573b0

在 select kernel 里，点击 Select Another Kernel，此后选择 Existing Jupyter Server，在弹出的窗口里输入上面得到的 server 链接，并选择弹出的 R。图示：

此后即可在 jupyter notebook 中使用 R 进行分析：